स्नातकोत्तर

स्नातकोत्तरसैद्धांतिक और संगणकीय रसायन विज्ञानअणुगतिकी सिमुलेशन


बल क्षेत्र और ऊर्जा न्यूनतमकरण


परिचय

बल क्षेत्र और ऊर्जा न्यूनतमकरण आणविक गतिकी सिमुलेशनों में एक प्रमुख भूमिका निभाते हैं, जो परमाणुओं और अणुओं के व्यवहार को विशेष वातावरण में सिमुलेट और समझने का तरीका प्रदान करते हैं। यह विषय सैद्धांतिक और संगणकीय रसायनशास्त्र का केंद्रीय है और इसका व्यापक उपयोग दवा खोज, सामग्री विज्ञान, और यहां तक कि जैव रसायनशास्त्र में होता है। इस व्यापक लेख में, हम इन अवधारणाओं का गहनता से अन्वेषण करेंगे, उपयोग किए गए तरीकों और उनके महत्व की जानकारी प्रदान करेंगे।

बल क्षेत्र क्या है?

आणविक सिमुलेशनों के संदर्भ में, एक बल क्षेत्र गणितीय समीकरणों और मापदंडों का एक संग्रह है जो आणविक प्रणाली की संभाव्य ऊर्जा का अनुमान लगाने के लिए उपयोग किया जाता है। यह मुख्य रूप से परमाणुओं या अणुओं के संग्रह के बीच बलों को वर्णित करता है।

संभाव्य ऊर्जा = बंधित ऊर्जा + गैर-बंधित ऊर्जा

बंधित अंतःक्रियाएँ

बंधित अंतःक्रियाओं में शामिल हैं:

  • बंध खींचाव
  • झुकाव कोण
  • घूर्णन (डाइहेड्रल) कोण

बंध खींचावझुकाव कोणघूर्णन (डाइहेड्रल) कोण

बंध खींचाव वर्णन करता है कि बंध लंबाई अपनी साम्य स्थिति के आसपास कैसे बदलती है। कोण झुकाव उन दो बंधों द्वारा निर्मित कोण में बदलाव के साथ संबंधित है जिनका एक आम परमाणु होता है। डाइहेड्रल कोण दो परमाणुओं के बीच बंध का घूर्णन बताता है।

गैर-बंधित अंतःक्रियाएँ

इनमें शामिल हैं:

  • वान डेर वाल्स बल
  • इलेक्ट्रोस्टैटिक अंतःक्रियाएँ

वान डेर वाल्सइलेक्ट्रोस्टैटिक

वान डेर वाल्स बलें कमजोर आकर्षण या विकर्षण होते हैं जो न्यूट्रल परमाणुओं के बीच उत्पन्न होते हैं, जबकि इलेक्ट्रोस्टैटिक अंतःक्रियाएँ चार्जकणों के बीच उत्पन्न होती हैं।

बल क्षेत्र के घटक

बल क्षेत्र पारामीट्राइज्ड सिस्टम होते हैं जो विभिन्न घटकों से बने होते हैं:

  • मापदंड : इनमे बल स्थिरांक, साम्य बंध लंबाई, कोण आदि शामिल होते हैं जो प्रत्येक परमाणु प्रकार के लिए परिभाषित होते हैं।
  • फंक्शनल फॉर्म : ये गणितीय अभिव्यक्तियाँ होती हैं जो परमाणुओं की अंतःक्रियाओं को वर्णित करती हैं, जैसे वान डेर वाल्स बल के लिए लैनार्ड-जोंस संभाव्यता।

बल क्षेत्र का निर्माण इन घटकों को कैलिब्रेट करके किया जाता है ताकि वे प्रयोगात्मक डेटा या उच्च-स्तरीय क्वांटम मैकेनिकल गणनाओं के साथ मेल खा सकें।

संभाव्य ऊर्जा = k_b( b - b_0 )^2 + k_a( theta - theta_0 )^2 + k_t( varphi - varphi_0 )^2 + V_M(sigma/r)^{12} - V_M(sigma/r)^{6} + sum_i q_i q_j / r_{ij}

यहाँ, ( k_b ), ( k_a ), ( k_t ), आदि बल स्थिरांक हैं, और ( b ), ( theta ), और ( varphi ) जैसे शब्द बंध लंबाई, कोण, और डाइहेड्रल कोण होते हैं। ((sigma/r)) लैनार्ड-जोंस संभाव्यता शब्दों का प्रतिनिधित्व करता है।

आणविक गतिकी में ऊर्जा न्यूनतमकरण

ऊर्जा न्यूनतमकरण एक प्रक्रिया है जो आणविक सिमुलेशनों में एक आणविक प्रणाली की एक स्थिर विन्यास प्राप्त करने के लिए उपयोग की जाती है द्वारा न्यूनतम संभाव्य ऊर्जा की स्थिति तक पहुँचकर।

ऊर्जा न्यूनतमकरण का महत्व:

  • स्थिर टकराव को हटाता है - अवास्तविक परमाणु टकराव, ओवरलैपिंग को कम करता है, के फलस्वरूप ढीली ज्यामिति होती है।
  • यह प्रणाली को गहन सिमुलेशनों जैसे कि आणविक गतिकी के लिए तैयार करता है।
  • आणविक प्रणालियों द्वारा खोजे गए ऊर्जा लैंडस्केप में महत्वपूर्ण अंतर्दृष्टि प्रदान करता है।

ऊर्जा न्यूनतमकरण विधियाँ

मुख्य तकनीकों में ग्रेडिएंट डिसेंट, न्यूटन-रैप्सन, और कंजुगेट ग्रेडिएंट विधियाँ शामिल हैं।

ग्रेडिएंट डिसेंट

आणविक पोटेंशियल सतह के ग्रेडिएंट के साथ आणविक गणों को धीरे-धीरे समायोजित करता है जब तक एक स्थानीय न्यूनतम तक नहीं पहुँच जाता है।

ऊर्जा सतह

यह सरल और सहज विधि संभाव्यता की ढलान की गणना करती है और न्यूनतम की दिशा में कोऑर्डिनेट्स को बार-बार समायोजित करती है।

न्यूटन-रैप्सन

यह विधि न्यूनतम को अधिक कुशलता से खोजने के लिए दूसरे डेरिवेटिव (हेसियन मैट्रिक्स) का उपयोग करती है, विशेषकर न्यूनतम के पास।

हालाँकि यह ग्रेडिएंट डिसेंट की तुलना में अधिक सटीकता-उन्मुख है, यह हेसियन की गणना की आवश्यकता होती है, जिससे यह संगणकीय रूप से गहन हो जाती है।

कंजुगेट ग्रेडिएंट

यह विधि न्यूटन-रैप्सन से संगणकीय रूप से सस्ती और बड़े प्रणालियों के लिए साधारण ग्रेडिएंट डिसेंट की तुलना में अधिक कुशल है।

यह पिछले चरणों में खोजे गए दिशाओं का लाभ उठाते हुए ग्रेडिएंट डिसेंट दृष्टिकोण को सुधारता है।

बल क्षेत्र और ऊर्जा न्यूनतमकरण के अनुप्रयोग

ये विधियाँ और सिद्धांत रसायनशास्त्र और जीवविज्ञान के विभिन्न क्षेत्रों में लागू किए जा सकते हैं:

  • प्रोटीन वल्लीकरण : यह समझने की कि प्रोटीन्स अपनी कार्यात्मक रूप कैसे प्राप्त करते हैं।
  • दवा डिजाईन : दवाओं के अपने लक्ष्यों के साथ अंतःक्रियाओं की पूर्वानुमान करना।
  • सामग्री विज्ञान : विशेष यांत्रिक गुणों वाली सामग्री का डिजाईन करना।
  • एंजाइम तंत्र अध्ययन : एंजाइम में उत्प्रेरक प्रक्रियाओं की अंतर्दृष्टि।

निष्कर्ष

बल क्षेत्र और ऊर्जा न्यूनतमकरण रसायनशास्त्र में संगणकीय अध्ययन के लिए अभिन्न हैं, आणविक अंतःक्रियाओं और गतिकी में अंतर्दृष्टि प्रदान करते हैं। गणितीय मॉडलों का उपयोग कर सिमुलेशन और व्यवहार की भविष्यवाणी द्वारा, वैज्ञानिक आभासी प्रयोग कर सकते हैं, जो रासायनिक खोज और इंजीनियरिंग में नवाचार को तेजी से बढ़ाते हैं।

इन विधियों की जटिलताओं को समझना आणविक विज्ञान में नई अंतर्दृष्टि प्रदान कर सकता है, और विभिन्न रासायनिक क्षेत्रों में जटिल निर्णय लेने और परिकल्पना परीक्षण करने में सहायता कर सकता है।


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